Universitas Islam Negeri (UIN) Sunan Ampel Surabaya menerapkan sistem pembayaran Uang Kuliah Tunggal (UKT). Pembayaran dilakukan sebelum kegiatan pembelajaran dijalankan pada masing-masing semesternya. Berikut besaran UKT masing-masing kelompok di prodi HES:

1. UKT 1: Rp.    400.000,-
2. UKT 2: Rp. 1.470.000,-
3. UKT 3: Rp. 2.935.000,-
4. UKT 4: Rp. 4.400.000,-
5. UKT 5: Rp. 5.870.000,-
6. UKT 6: Rp. 7.340.000,-
7. UKT 7: Rp. 8.560.000,-

 Keterangan: Semua pembayaran yang telah dilakukan tidak dapat ditarik/dialihkan.